Если Вы анимируете воду в материале, ничего не выйдет, поскольку материал не переносится в движок, маскимум название перенесется и цвет дифуза. Сложные нодовые системы отличаются в программных пакетах и fbx или любой другой формат переноса их не поддерживает. Если каким то образом у Вас получится санимировать меш воды через Morph target (Морф анимация) то ее можно перенести в UE4 как положения вершин, и через код или блупринты включить между ними переходы, включить морф анимацию.
Но самый верный способ это сделать анимированный шейдер воды прямо в UE4. Для этого в движке есть все необходимое.
.