Вам нужно создать три материала:
- Один общий для всех кубиков
- Один с одной текстурой
- Один с другой текстурой
А у Вас и цвет куба и его текстура относятся к одному материалу, что в данном случае не приемлемо.
Но это не единственный выход. Вот есть отличный урок, в котором с помощью одного материала задают 9 текстур и 9 цветов для любого количества объектов.
Каким способом пойти — решать Вам.