хм, ну obj насколько помню, не поддерживает анимацию, только инфу о геометрии. Теоретически можно экспортировать анимацию в obj — но ты получишь столько файлов, сколько у тебя кадров (т.е. на 30 кадров ты получишь 30 .obj с моделями, соответствующими каждому кадру анимации). Читай спецификации.
юзай лучше fbx — его везде съедят