После экспорта в FBX и обратного импорта грани снова выделяются зеленым.
О Боже! Священника не пробовал вызывать?
P.S. Ты пометил грани для движка рендеринга Freestyle. Как убрать, да? Зайди в меню граней и сними с них эту метку. Где меню граней, да? В меню Mesh (или как профи Ctrl + F).