По сути вопрос именно в ушах, потомучто все остальное отображается вполне корректно. Выходит только ручная ретопология мне в помощь?
Если говорить конкретно о вас, то да. Руками подправили уши и все. Но сам модификатор никак не ограничен и с ушами проблемы по вашей вине. Это не его технические ограничения. Объекты могут быть сколь угодно сложными. Просто не всегда достаточно легко и быстро подогнать их друг под друга, чтобы результат удовлетворял. Чаще проще руками поправить.
P.S. Увидел ваш пост после своего. Хорошо все, что хорошо заканчивается :)