Спасибо за ответ!
Проблема решилась сама собой, на следующий день (может помогла перезагрузка?).
Если кто столкнется с подобной проблемой можно попробовать пересохранить в формат wrl.
Но возникла следующая проблема.
Вода по трубам мягко говоря «не хочет течь». геометрия труб простая и с каждым поворотом трубопровода вода сильно замедляется а иногда и вообще тормозит по середине трубы. Тут пригодился Ваш совет, поднятие разрешения для симуляции, увеличение скорости объекта типа inflow, и параметра Speed в domain немного выравнивают ситуацию но процесс «запекания» сильно затягивается и в результате вода очень неохотно проталкивается по трубам, а иногда и не течет вовсе.
Но если создать более сложную геометрию трубопровода в Blender, даже при низких параметрах разрешения симуляции все работает как часы.
Может есть какой-то способ преобразовать геометрию из SolidWorks в Блендере ?
Как-то пересчитать Mesh или какой-то специальный аддон ?