Нет, вручную точно не вариант. А вот насчет может или нет, тут я не знаю. Сам OBJ с MTL ни разу не экспортировал и не интересовался.
Хотя вот тут парни пишут что может, при чем все на автомате:
http://blender.stackexchange.com/questions/5110/how-to-import-a-mtl-file
Может при импорте чекбокс какой нужно поставить?
