Ответ в теме: Объединение нескольких анимаций

[Артем Слаква]

Вопрос, стоит ли их скелеты и меши объединять во едино и затем анимировать или всё же по этапно каждый анимировать отдельно.

Нет, не стоит. Анимируй каждого персонажа по отдельности.