Спасибо за совет, да за основу брал турбулентность и располагал ее в ключевых точках плоскости, изменял силу на определенное количество кадров, так же для молекулы уменьшил массу, увеличил силу отскока от поверхности плоскости, а для мира установил меньшую гравитационную постоянную. Молекулы либо зависали в «воздухе» либо медленно двигались по самой плоскости.
P.S. В Блендере работать начал совсем недавно и многих тонкостей не знаю.